Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAX2Q96IS3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms