Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC34Q96HJ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC34Q96HJ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms