Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP36Q96G28 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms