Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRRFQ96E11 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRRFQ96E11 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms