Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RNF183Q96D59 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RNF183Q96D59 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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RNF183Q96D59 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RNF183Q96D59 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF183Q96D59 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RNF183Q96D59 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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