Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBGCP3Q96CW5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBGCP3Q96CW5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms