Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TM4SF18Q96CE8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM4SF18Q96CE8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms