Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CCDC74AQ96AQ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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CCDC74AQ96AQ1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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CCDC74AQ96AQ1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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CCDC74AQ96AQ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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