Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKD1Q969G9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms