Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms