Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX38Q92620 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms