Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM41Q8WV44 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM41Q8WV44 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms