Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC7Q8WUI4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC7Q8WUI4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms