Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HAVCR2Q8TDQ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms