Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX54Q8TDD1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms