Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL2Q8NEU8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL2Q8NEU8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms