Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHDC9Q8NEP7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms