Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms