Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFCDQ8IXH7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms