Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms