Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR49Q8IV35 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR49Q8IV35 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms