Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP1Q86WV1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms