Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RASSF3Q86WH2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RASSF3Q86WH2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASSF3Q86WH2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASSF3Q86WH2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RASSF3Q86WH2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASSF3Q86WH2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASSF3Q86WH2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms