Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIBP1Q86W92 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms