Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms