Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP1R42Q7Z4L9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R42Q7Z4L9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms