Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP3Q7RTS5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms