Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP43Q70EL4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP43Q70EL4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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