Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM43BQ6ZT52 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM43BQ6ZT52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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