Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM43Q6ZSC3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms