Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO4C1Q6ZQN7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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