Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFXL1Q6ZNB6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms