Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUSD1Q6UWL2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD1Q6UWL2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms