Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO3Q6UWJ1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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