Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
METAP1DQ6UB28 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
METAP1DQ6UB28 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms