Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED9Q6R2W3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED9Q6R2W3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms