Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms