Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI2

GPAT2, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2Q6NUI2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAT2Q6NUI2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAT2Q6NUI2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAT2Q6NUI2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPAT2Q6NUI2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPAT2Q6NUI2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPAT2Q6NUI2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPAT2Q6NUI2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms