Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms