Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LCN8Q6JVE9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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LCN8Q6JVE9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LCN8Q6JVE9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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