Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL3Q6DD88 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL3Q6DD88 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms