Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD40Q6AI12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms