Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms