Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf53Q5VUE5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf53Q5VUE5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms