Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DIPQ5VU43 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms