Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBAP2Q5T6F2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms