Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC122Q5T0U0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms