Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf220Q5T0J3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf220Q5T0J3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms