Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms