Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms